经过一年多的剧本雕琢，二十集电视连续剧《深呼吸》为观众真实再现了一场严重环保事件背后的情感与阴谋：浠水市的支柱企业极风药业公司，因拖欠医药费，被本厂的48位退休职工告上法庭，开庭当日，47位原告突然撤诉，原告律师吴晓霜将最后一线希望寄予还未到庭的下岗女工肖秀萌，肖秀萌在赶往法庭的路上，与阻拦他的药厂职工尤二勇发生冲突，没想到两人推搡时，尤二勇倒地猝死，肖秀萌被公安局拘留。
极风药业派律师黄明哲找到尤二勇的哥哥尤大勇，劝其息事宁人，损失由药厂补偿，药厂一系列不合常规的举动，引起了吴晓霜与记者周飞扬的警觉，意识到事件的背后定有隐情。
浠水市中心医院的脑外科主任孟子凡亲自主持了尤二勇的解剖工作，鉴定为脑动脉瘤突然破裂死亡，肖秀萌无罪释放，巧合的是，肖秀萌的母亲也被查出脑动脉瘤住进了医院，不久女儿蕾蕾也得了一种怪病住进了医院，而母亲和女儿的病让肖秀萌欲调查真相，而极风药业矢口否认脑动脉瘤与药厂排污有关，拿出了环保局的检测合格报告，同时破天荒的为经济窘迫的肖秀萌垫付了医药费，但肖秀萌不为所动，坚持与吴晓霜一起调查。
孟子凡同情肖秀萌的遭遇，请让其来家做保姆,让肖秀萌万万意想不到的，到孟家的第一晚便遇见自己十二年前的初恋情人，孟子凡的丈夫——付市长雷思成，而年轻有为的雷思成正是极风药业公司的主管领导，正是他把极风药业公司树为模范企业，极风药业公司的董事长李宏刚是他一手提拔起来的……
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